背景介绍

金年会金字招牌诚信至上致力于推动生物医疗领域的科学研究与技术进步。互作转录组测序技术DualRNA-seq是一种先进的研究工具，专门用于探讨宿主与微生物之间的相互作用。该技术无需分离不同物种，能够在一次实验中同时分析多个互作物种的基因表达动态变化。通过建立互作模型图，研究人员可以揭示物种之间基因调控的关系，从而深入了解其相互作用的机制。

技术应用

起初，DualRNA-seq技术主要应用于研究感染性肺炎、炎症性肠病、龋齿和牙周炎等常见慢性感染性疾病的致病机制及宿主免疫应答。随着研究的深入，该技术逐步扩展到肠道、呼吸道、皮肤及口腔微生物的分析，涵盖了从原核微生物到真核微生物的互作研究。此外，植物与微生物的互作也得到了广泛关注，成为研究的热点。

技术路线图

根据WTetal（2017）的研究，DualRNA-seq的实验流程包括多个步骤，从宿主与微生物的共提取到后续的测序和生信分析，形成了一条完整的技术路线。以下是实验方案的步骤和相关产品推荐：

实验方案步骤

金年会金字招牌诚信至上推荐的实验产品包括：

• 宿主-微生物共提取：MolPure®磁珠法病原DNA/RNA提取试剂盒（货号：18306ES）
• gDNA消化：Deoxyribonuclease I (DNase I) from bovine pancreas（货号：10607ES）
• rRNA去除：微生物和植物-微生物互作的特定核糖体去除试剂盒（货号：12262ES，12264ES）
• 总RNA建库：Hieff NGS® EvoMax RNA Library Prep Kit (dUTP)（货号：12340ES）
• 测序：Illumina或MGI，建议选择带UMI标签的接头（如货号：13370ES~13371ES）

关键点强调

在进行DualRNA-seq实验时，有两个关键点需要特别注意。首先，样本选择至关重要。应该获取被感染的样本，然而在实际操作中，寄生微生物的含量可能较低，例如提取被寄生植物的叶片或根茎时，大部分RNA可能是植物源；提取动物组织时则大部分为感染动物的RNA。其次，生物信息学分析也是重要环节，需在实验前后进行差异比较，并深入分析差异基因是否在互作中发挥作用。

参考文献

1. Westermann AJ, Barquist L, Vogel J. Resolving host-pathogen interactions by dual RNA-seq. Plos Pathogens, 2017, 13(2): e1006033
2. Wolf T, Kämmer P, Brunke S, et al. Two's company: studying interspecies relationships with dual RNA-seq. Current Opinion in Microbiology, 2017, 42: 73
3. Marsh JW, Humphrys MS, Myers GSA. A Laboratory Methodology for Dual RNA-Sequencing of Bacteria and their Host Cells In Vitro. Front Microbiol, 2017 Sep 21; 8: 1830